Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snd1Q78PY7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snd1Q78PY7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snd1Q78PY7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 372.7 ms