Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eci3Q78JN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eci3Q78JN3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eci3Q78JN3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eci3Q78JN3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms