Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mvb12aQ78HU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mvb12aQ78HU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Mvb12aQ78HU3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms