Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ssh1Q76I79 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ssh1Q76I79 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ssh1Q76I79 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ssh1Q76I79 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssh1Q76I79 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms