Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SynmQ70IV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SynmQ70IV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SynmQ70IV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SynmQ70IV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SynmQ70IV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SynmQ70IV5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SynmQ70IV5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SynmQ70IV5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SynmQ70IV5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms