Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d2bQ6ZWY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms