Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup188Q6ZQH8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup188Q6ZQH8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup188Q6ZQH8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms