Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg5Q6ZPY2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg5Q6ZPY2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg5Q6ZPY2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg5Q6ZPY2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg5Q6ZPY2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg5Q6ZPY2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg5Q6ZPY2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms