Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ino80Q6ZPV2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ino80Q6ZPV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ino80Q6ZPV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ino80Q6ZPV2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ino80Q6ZPV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ino80Q6ZPV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms