Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb5Q6XAS2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb5Q6XAS2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb5Q6XAS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb5Q6XAS2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms