Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcp4l1Q6W8Q3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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