Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a2Q6PIE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a2Q6PIE5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1a2Q6PIE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a2Q6PIE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms