Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dhx40Q6PE54 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dhx40Q6PE54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dhx40Q6PE54 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dhx40Q6PE54 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms