Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sarm1Q6PDS3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sarm1Q6PDS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms