Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL7

Ahdc1, AT-hook DNA-binding motif-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ahdc1Q6PAL7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ahdc1Q6PAL7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Ahdc1Q6PAL7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ahdc1Q6PAL7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ahdc1Q6PAL7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ahdc1Q6PAL7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ahdc1Q6PAL7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms