Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp49Q6P9L4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp49Q6P9L4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp49Q6P9L4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp49Q6P9L4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp49Q6P9L4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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