Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rprd2Q6NXI6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rprd2Q6NXI6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rprd2Q6NXI6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rprd2Q6NXI6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms