Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWV3

Ift122, Intraflagellar transport protein 122 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift122Q6NWV3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ift122Q6NWV3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ift122Q6NWV3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ift122Q6NWV3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ift122Q6NWV3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms