Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpsf6Q6NVF9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpsf6Q6NVF9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpsf6Q6NVF9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms