Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Wdr44Q6NVE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr44Q6NVE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Wdr44Q6NVE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Wdr44Q6NVE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wdr44Q6NVE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms