Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pdcd11Q6NS46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pdcd11Q6NS46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pdcd11Q6NS46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Pdcd11Q6NS46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pdcd11Q6NS46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms