Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NipblQ6KCD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NipblQ6KCD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NipblQ6KCD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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