Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm4Q6IRU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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