Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt40Q6IFX3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt40Q6IFX3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt40Q6IFX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt40Q6IFX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt40Q6IFX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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