Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KdsrQ6GV12 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KdsrQ6GV12 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KdsrQ6GV12 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KdsrQ6GV12 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms