Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScapQ6GQT6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ScapQ6GQT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ScapQ6GQT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ScapQ6GQT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ScapQ6GQT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms