Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scaf8Q6DID3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scaf8Q6DID3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scaf8Q6DID3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scaf8Q6DID3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms