Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Smarca2Q6DIC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Smarca2Q6DIC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Smarca2Q6DIC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Smarca2Q6DIC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Smarca2Q6DIC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Smarca2Q6DIC0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Smarca2Q6DIC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms