Protein–RNA interactions for Protein: Q64264

Htr1a, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1aQ64264 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr1aQ64264 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr1aQ64264 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr1aQ64264 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr1aQ64264 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms