Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
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