Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc18Q640L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc18Q640L5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc18Q640L5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ccdc18Q640L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc18Q640L5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc18Q640L5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms