Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd33Q63994 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd33Q63994 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd33Q63994 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms