Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Kcnc3Q63959 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Kcnc3Q63959 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Kcnc3Q63959 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20,91■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,9■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Kcnc3Q63959 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Kcnc3Q63959 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Kcnc3Q63959 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms