Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2kQ63871 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2kQ63871 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2kQ63871 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms