Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3gl2Q62420 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3gl2Q62420 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3gl2Q62420 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms