Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Supt6hQ62383 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Supt6hQ62383 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Supt6hQ62383 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Supt6hQ62383 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Supt6hQ62383 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms