Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema5aQ62217 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema5aQ62217 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema5aQ62217 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema5aQ62217 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema5aQ62217 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms