Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sycp1Q62209 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp1Q62209 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms