Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l1Q61985 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2l1Q61985 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nfe2l1Q61985 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms