Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mrc1Q61830 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mrc1Q61830 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mrc1Q61830 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mrc1Q61830 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms