Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LbpQ61805 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LbpQ61805 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LbpQ61805 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LbpQ61805 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbpQ61805 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LbpQ61805 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LbpQ61805 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LbpQ61805 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LbpQ61805 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LbpQ61805 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LbpQ61805 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms