Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin1Q61644 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pacsin1Q61644 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin1Q61644 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms