Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EsrrbQ61539 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EsrrbQ61539 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EsrrbQ61539 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EsrrbQ61539 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms