Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dsg1aQ61495 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dsg1aQ61495 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dsg1aQ61495 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg1aQ61495 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms