Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rev3lQ61493 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rev3lQ61493 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rev3lQ61493 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rev3lQ61493 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms