Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnna2Q61301 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnna2Q61301 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna2Q61301 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna2Q61301 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms