Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CybbQ61093 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CybbQ61093 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CybbQ61093 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CybbQ61093 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CybbQ61093 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CybbQ61093 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CybbQ61093 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CybbQ61093 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CybbQ61093 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CybbQ61093 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CybbQ61093 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CybbQ61093 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CybbQ61093 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CybbQ61093 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CybbQ61093 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CybbQ61093 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CybbQ61093 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CybbQ61093 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CybbQ61093 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CybbQ61093 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CybbQ61093 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms