Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamb3Q61087 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lamb3Q61087 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lamb3Q61087 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lamb3Q61087 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms