Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HarsQ61035 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HarsQ61035 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HarsQ61035 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HarsQ61035 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HarsQ61035 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HarsQ61035 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HarsQ61035 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HarsQ61035 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HarsQ61035 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms