Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
JrkQ60976 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JrkQ60976 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JrkQ60976 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JrkQ60976 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JrkQ60976 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
JrkQ60976 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JrkQ60976 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JrkQ60976 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms