Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp7Q60973 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rbbp7Q60973 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp7Q60973 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp7Q60973 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms